заполнила декларацию, доход только в виде зп, налог уже удержан был работодателем в полном объеме. В итоге по декларации я еще должна денег. Подозреваю, что кроме ГЕСИ надо указать еще отчисления в социальный фонд. Это так?

Да. Все данные из emoluments certificate

из TD63 который вам дал работодатель, в 4 разделе налоговой декларации рядом с зарплатой есть графы для социалки и геси