Подскажите плиз, если я налоговый резидент кипра, и у меня есть ИП в РФ на упрощенке, я должен ли указывать в декларации выручку по ИП и будет ли это считаться доходом физлица? Иными словами, если я заплатил в рф 6% налогов с ИП, то я надеюсь тут ничего не надо еще платить?

Поищите обсуждение в поиске. Если кратко - да, надо платить по ставке Кипра, ваши 6% в РФ - это спецрежим и не зачитывается. По всей поступившей выручке.