Добрый вечер! Есть ли опция получить новый загранпаспорт взамен старого через консульство РФ в Никосии, если внутренний паспорт недействителен в связи с достижением 45лет? Может быть отдельно рассматриваются такие кейсы? Человек не может надолго выезжать с Кипра, и не выезжал никуда последние 15лет по причине монашества.

Внутренний паспорт не является обязательным документом, и его просроченность никак не влияет на получение заграничного в консульстве.

Я ориентировался на данные требования. Да и при заполнении формы на сайте также требуется вписать номер гражданского паспорта - и эта ячейка подсвечивается красным и не дает отправить всю форму.

https://cyprus.mid.ru/ru/consular-services/oformlenie_biometricheckogo_pasporta_na_10_let/

п.1 ваш, про внутренний написано при его наличии.

Общегражданский паспорт не нужен для получения заграна, если есть действующий загран

Действующий загран истекает послезавтра

Тогда человек не может находиться легально на Кипре.

если на момент подачи не будет действующих паспортов, то необходимо будет пройти процедуру подтверждения наличия гражданства.