Уточню, для получения 50% скидки учитывается весь доход физ лица? Или только от работадателя? Возможно не так понял про прибыль с аренды)

От работодателя. В примере выше Rent allowance - это не "прибыль с аренды", это "компенсация жилья" от работодателя, прописанная в договоре с ним